La historia del Bachillerato 25 comienza con la fundación del Bachillerato 17, siendo creado este último el 22 de noviembre de 1979 por el entonces rector Lic. Jorge Humberto Silva Ochoa, iniciando labores en las instalaciones de la secundaria Técnica No. 5 “Pablo Silva García”, en turno vespertino, siendo designado como primer director el Prof. Carlos Flores Dueñas.
En mayo de 1994, se inauguraron las instalaciones del ejido “El Pedregal”, en el periodo rectoral del Lic. Fernando Moreno Peña, siendo la directora CP. Ma. Guadalupe Brizuela Venegas. En el periodo rectoral del Dr. Carlos Salazar Silva, como parte del programa reforma académica del bachillerato se ofertó el área de técnico en contabilidad.
En el año 2000, se incrementó el número de estudiantes, por lo que se ofertó el turno matutino y es cuando se nombra director por turno. El 19 de agosto del 2004, el Prof. Gustavo Alberto Vázquez Montes, gobernador del estado y el Dr. Carlos Salazar Silva, entregan las nuevas instalaciones que actualmente albergan las oficinas administrativas, el módulo de cómputo, la biblioteca y tres aulas.
El 28 de noviembre de 2007, surge el Bachillerato 25 como opción matutina y desaparece el Bachillerato 17 que ocupaba el mismo turno.
A la fecha, los directores y directoras que han ocupado el cargo en este Bachillerato han sido los siguientes: