La Facultad de Ciencias Biológicas y Agropecuarias (FCBA), dependencia de la Universidad de Colima con 36 años de existencia, se funda el 25 de junio de 1976, iniciando sus funciones el 1° de febrero de 1977, en el campus Colima, con la denominación de Escuela Superior de Agricultura (ESA). Su primer Director fue el C. Ing. Lorenzo Hernández Arreguín, siendo Rector en ese entonces el Lic. Alberto Herrera Carrillo. Sin tener instalaciones propias, se empezó el primer semestre en las aulas de la Escuela de Ingeniería Civil y Topografía. Las prácticas de campo se realizaban en el Rancho “El Crucero”, a 40 km de distancia, en el municipio de Tecomán, Colima. El plan de estudios contemplaba cuatro semestres de tronco común y dos salidas: Ingeniero Agrónomo Fitotecnista, con una duración total de nueve semestres e Ingeniero Agrónomo Zootecnista, con diez semestres.
En 1979, se crea la Dirección General de Educación Agropecuaria (DGEA) con la intención de organizar el área agropecuaria de la Universidad, conformada por la Escuela de Agricultura (nivel medio superior), la recién formada Escuela de Medicina Veterinaria y Zootecnia y la E.S.A. Esa dependencia (DGEA), tenía la función de administrar el Rancho “El Crucero”, los talleres de productos lácteos, cárnicos y de frutas, mediante un organismo denominado “Administradora Universitaria de Producción Industrial y Agropecuaria” (AUPIA). El objetivo de esas dependencias fue administrar los bienes económicos del Rancho para beneficio de la actividad académica de las escuelas del ramo agropecuario.
En ese mismo año ocurrieron dos hechos importantes, el primero fue que la ESA. se traslada de la ciudad de Colima al Rancho “El Crucero” en Tecomán, donde se construyó un laboratorio multidisciplinario cuyos espacios funcionarían como aulas y laboratorios por un semestre, ya que las aulas estaban en proceso de construcción. El segundo hecho fue el cambio de nombre de ESA a Escuela Superior de Ciencias Agropecuarias (ESCA), siendo Director el C. Ing. Carlos Aguayo Sierra.
Posteriormente, en 1985, se da un paso más en el proceso de la educación agropecuaria creándose la Maestría en Biología de la Producción con área en Microbiología, elevándose entonces la Escuela a rango de Facultad; es a partir de entonces que lleva el nombre de Facultad de Ciencias Biológicas y Agropecuarias (F.C.B.A.). El Director que participó en el cambio de denominación fue el C. Ing. José María Salas González, bajo la tutela del entonces rector de la Universidad, C. Lic. J. Humberto Silva Ochoa.
En 1988, se crea la carrera de Ingeniero Agrónomo en Fruticultura, como resultado de un estudio regional, puesto que toda la planicie costera de los estados de Colima, Michoacán y Jalisco, eran productores de frutales como: plátano, limón, tamarindo, cocotero, mango, entre otros. Esta opción solamente abrió para tres generaciones, ya que la demanda estudiantil era muy escasa y no se rebasó la matrícula de siete estudiantes por semestre. En 1990, se crea el Doctorado en Biología de la Producción, siendo Director el C. Ing. Marcelino Bazán Tene y Rector el C. Lic. Fernando Moreno Peña, logrando ingresar al Padrón de Excelencia Académica en la evaluación que el entonces Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (Conacyt, hoy Conahcyt) otorga a los programas de posgrado.
A partir de 1989, nuevamente se hace un diagnóstico regional de la situación agropecuaria, donde se detectan sus tendencias y la problemática existente. De dicha problemática se derivó una disminución sustancial de la matrícula de las tres carreras que ofrecía la FCBA, consistente en una crisis económica que impactó fuertemente en el campo agrícola, aunado a políticas gubernamentales que afectaron a los agroproductores. Ese diagnóstico mostró la necesidad de fusionar las tres carreras en una sola, surgiendo así la carrera de “Ingeniero Agrónomo”, con conocimientos profundos de la problemática regional pero con una visión nacional, que permitiera a las y los egresados dar respuesta a las muchas preguntas del sector laboral.
El perfil del Ingeniero Agrónomo que se generó en ese entonces (Plan F4), fue el de un profesionista con conocimientos amplios en la Fruticultura y en los cultivos básicos, industriales, forrajeros y hortalizas, tradicionales y alternativos para la región, y con la capacidad para propiciar nuevas opciones de mercado que permitiera al campo buscar un incremento en su rentabilidad.
En el año 2000, se reestructura nuevamente el plan de estudios de la carrera de Ingeniero Agrónomo (Plan F901) con una base rígida en la planeación, pero que en la operatividad se ha flexibilizado; así los estudiantes tuvieron la posibilidad de realizar procesos de movilidad académica tanto nacional como internacional, aunque solo se incluía la movilidad promovida por la Institución. A partir del 2004, la FCBA oferta también la carrera de Licenciado en Biología con ocho semestres y un modelo educativo centrado en el estudiante autodidacta, con el profesor como guía. En su primera generación egresaron 22 estudiantes.
En 2008, inician las primeras reuniones que darían pie a la reestructuración del Plan F901 de Ingeniero Agrónomo para pasar de un currículo rígido a uno flexible y con la implementación de un modelo curricular institucional basado en competencias; proceso que concluye hasta el año 2012.
La FCBA se localiza en el Campus Tecomán de la Universidad de Colima, en el Km. 40 Autopista Colima-Manzanillo; forma parte de la DES Ciencias Agropecuarias junto con la Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia (FMVZ) y el Centro Universitario de Investigación y Desarrollo Agropecuario (CUIDA). Se fundó el 25 de junio de 1976, como Escuela Superior de Agricultura (ESA), en el Campus Colima. En 1979 se crea la Dirección General de Educación Agropecuaria (DGEA), al mismo tiempo que el PE adopta la denominación de Escuela Superior de Ciencias Agropecuarias. A partir de 1985, y ya ubicado en Tecomán, cambió su nombre a Facultad de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Actualmente, se imparten 2 carreras: Ingeniero Agrónomo y Licenciado en Biología, esta última inició en agosto del 2004. Cuenta con tres cuerpos académicos, dos consolidados y uno en consolidación. El PE de Ing. Agrónomo está acreditado por el COMEAA, organismo reconocido por COPAES a partir del 07 de mayo de 2007 y el PE de Lic. en Biología fue evaluado por CACEB los días 28 al 30 de septiembre del 2009 y el 15 de febrero de 2010 se nos fue otorgada la acreditación.