Dr. Yair Cárdenas Conejo

Proyectos Internacionales

TÍTULO: Desarrollo de métodos avanzados de detección de fitovirus, con énfasis en la identificación de begomovirus, en colaboración con la Animal and Plant Quarantine Agency (APQA) de Corea.

MODALIDAD: Colaboración internacional de 7 países.

ENTIDAD FINANCIADORA: Animal and Plant Quarantine Agency (APQA), Corea.

VIGENCIA: 2024-2026

MONTO TOTAL: 22,500 USD.

Proyectos Nacionales

TÍTULO: Ingeniería de Plantas: Diseño de plantas resistentes a los Begomovirus de mayor importancia en México basado en microRNAs.

CONVOCATORIA: Atención a Problemas Nacionales 2015.

NÚMERO DE PROYECTO: APN-2015-741

MODALIDAD: Proyecto Individual - Responsable técnico.

ENTIDAD FINANCIADORA: CONACYT.

VIGENCIA: 2016-2018

MONTO TOTAL: 1,500,000 pesos.

TÍTULO: Mantenimiento y Rehabilitación de equipo especializado para apoyar la creación del primer Laboratorio de Biología Sintética, Estructural y Molecular del Estado de Colima.

CONVOCATORIA: Infraestructura 2021.

NÚMERO DE PROYECTO: INFR-2021-17-316456

MODALIDAD: Proyecto grupal - Responsable técnico.

ENTIDAD FINANCIADORA: CONAHCYT

VIGENCIA: 2021

MONTO TOTAL: 850,000 pesos.

TÍTULO: Estrategia no transgénica para el control y diagnóstico de begomovirus en cultivos agrícolas utilizando aptámeros de DNA y nanomateriales.

CONVOCATORIA: Ciencia Básica y de Frontera 2025

NÚMERO DE PROYECTO: CBF-2025-G-902

MODALIDAD: Proyecto grupal – Responsable técnico

ENTIDAD FINANCIADORA: Secretaría de Ciencia, Humanidades, Tecnología e Innovación

VIGENCIA: 2026-2028

MONTO TOTAL: 1,900,000 pesos.

Bases de datos, software y recursos bioinformáticos

• Base de datos: GenomoBase - Base de datos pública para la familia Genomoviridae.
• Liga: https://www.genomobase.org
• Software: GeneDraft - Software local de escritorio para edición y análisis exploratorio de secuencias de DNA, RNA y proteínas.
• Liga: https://github.com/yaircardenas/GeneDraft

Publicaciones Recientes

1. Cárdenas-Conejo Y. (2026). GenomoBase: A comprehensive resource for the family Genomoviridae. Virology. 2026;111018. doi: 10.1016/j.virol.2026.111018.
2. Espinosa-Barrera L, Linares-Vergara O, Zermeño-Cervantes LA, Cárdenas-Conejo Y, Aranda-Caraballo J, Velázquez-Cruz B, López-Gutiérrez S, Romero-Jiménez M, Zuleta-Prada H, Osuna-Castro JA, et al. (2026). Identification and characterization of a novel lysin-like endopeptidase from the Vibrio cholerae predator phage ICP1. Protein Expr Purif. 2026 Apr 23;241:106935. doi: 10.1016/j.pep.2026.106935.
3. Cárdenas-Conejo Y, Argüello-Astorga GR, García-Rodríguez DA, Mendoza-Magaña DA, Bañuelos-Hernández B, Centeno-Leija S, Serrano-Posada H, Espinosa-Barrera LA, Uresti-Rivera EE, Loera-Valencia R. (2025). Endogenous geminivirus-like elements in the genus Rhododendron provide insights into the evolutionary origins of the begomovirus nuclear shuttle protein. Plant Mol Biol. 2025 Jul 3;115(4):81. doi: 10.1007/s11103-025-01609-2.
4. Ramírez-Maldonado LM, Guerrero-Castro J, Rodríguez-Mejía JL, Cárdenas-Conejo Y, Bonales-Alatorre EO, Valencia-Cruz G, Anguiano-García PT, Vega-Juárez II, Dagnino-Acosta A, Ruvalcaba-Galindo J, et al. (2025). Obesogenic cafeteria diet induces dynamic changes in gut microbiota, reduces myenteric neuron excitability, and impairs gut contraction in mice. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 2025 Jan 1;328(1):G32-G48. doi: 10.1152/ajpgi.00198.2024.
5. Dzib-Cauich J, Us-Camas R, Cárdenas-Conejo Y, Carballo-Uicab VM, Sierra-Ulín D, Aguilar-Espinosa M, Rivera-Madrid R. (2023). Carotenoid cleavage dioxygenases 4 from woodiness plant and their relationships with herbaceous plants. Ind Crops Prod. 2023;205:117529. doi: 10.1016/j.indcrop.2023.117529.
6. Aranda-Caraballo J, Sáenz RA, López-Zavala AA, Velázquez-Cruz B, Espinosa-Barrera L, Cárdenas-Conejo Y, Zárate-Romero A, Linares-Vergara O, Osuna-Castro JA, Bonales-Alatorre E, Centeno-Leija S, Serrano-Posada H. (2023). Binding Specificity of a Novel Cyclo/Maltodextrin-Binding Protein and Its Role in the Cyclodextrin ABC Importer System from Thermoanaerobacterales. Molecules. 2023;28(16):6080. doi: 10.3390/molecules28166080.
7. García-Rodríguez DA, Partida-Palacios BL, Regla-Márquez CF, Centeno-Leija S, Serrano-Posada H, Bañuelos-Hernández B, Cárdenas-Conejo Y. (2023). Sida chlorotic leaf virus: a new recombinant begomovirus found in non-cultivated plants and Cucumis sativus L. PeerJ. 2023 Mar 22;11:e15047. doi: 10.7717/peerj.15047.
8. Cárdenas-Conejo Y, Narváez-Zapata JA, Carballo-Uicab VM, Aguilar-Espinosa M, Us-Camas R, Escobar-Turriza P, Comai L, Rivera-Madrid R. (2023). Gene expression profile during seed development of Bixa orellana accessions varying in bixin pigment. Front Plant Sci. 2023 Feb 15;14:1066509. doi: 10.3389/fpls.2023.1066509.
9. Centeno-Leija S, Espinosa-Barrera L, Velázquez-Cruz B, Cárdenas-Conejo Y, Virgen-Ortiz R, Valencia-Cruz G, Sáenz RA, Marín-Tovar Y, Gómez-Manzo S, Hernández-Ochoa B, et al. (2022). Mining for novel cyclomaltodextrin glucanotransferases unravels the carbohydrate metabolism pathway via cyclodextrins in Thermoanaerobacterales. Sci Rep. 2022 Jan 14;12(1):730. doi: 10.1038/s41598-021-04569-x.
10. Sánchez-Chávez S, Regla-Márquez CF, Cárdenas-Conejo ZE, García-Rodríguez DA, Centeno-Leija S, Serrano-Posada H, Liñan-Rico A, Partida-Palacios BL, Cárdenas-Conejo Y. (2020). First report of begomoviruses infecting Cucumis sativus L. in North America and identification of a proposed new begomovirus species. PeerJ. 2020 Jul 10;8:e9245. doi: 10.7717/peerj.9245.
11. Cárdenas-Conejo Y, Liñan-Rico A, García-Rodríguez DA, Centeno-Leija S, Serrano-Posada H. (2020). An exclusive 42 amino acid signature in pp1ab protein provides insights into the evolutive history of the 2019 novel human-pathogenic coronavirus (SARS-CoV-2). J Med Virol. 2020 Jun;92(6):688-692. doi: 10.1002/jmv.25758.