La Universidad de Colima fue una de las primeras universidades de México en atender la convocatoria nacional para construir un programa nacional de estudios sobre la Cuenca del Pacífico, arropado por la conformación de la Comisión Mexicana de la Cuenca del Pacífico, el 15 de abril de 1988. De ahí que en 1989 iniciaron las labores de todo un proyecto en la materia, para que en mayo de 1990 se integrara la Red Nacional de Investigadores sobre la Cuenca del Pacífico, teniendo como primera sede nuestra institución.
De esa manera, los estudios sobre la Cuenca del Pacífico en la Universidad de Colima se incrementaron y dieron lugar a la apertura del Centro Universitario de Estudios e Investigaciones sobre la Cuenca del Pacífico (CUEICP), el cual se constituyó por acuerdo del Consejo universitario el 20 de marzo de 1995, siendo el Dr. Fernando Alfonso Rivas Mira su primer director. Así, el CUEICP inició sus actividades con el apoyo de académicos como María Elena Romero Ortiz, Juan González García, José Ernesto Rangel Delgado, Arturo García Vázquez y Saúl Martínez González.
Por su parte, el Centro de Estudios en el Área de Cooperación Económica Asia Pacífico (APEC, por sus siglas en inglés) de la Universidad de Colima se inauguró el 18 de septiembre de 1998, con la idea de fortalecer los estudios sobre APEC y mejorar el conocimiento de la región de la Cuenca del Pacífico, teniendo como primer director y fundador al embajador Omar Martínez Legorreta. Conformándose más tarde, en 2004, el Consorcio Mexicano de Centros de Estudios de APEC del cual la Universidad de Colima es fundadora, colaborando con la Secretaría de Economía de México.