El Instituto Universitario de Investigaciones Jurídicas fue creado por Acuerdo No. 10 del año de 1981, cuando era rector de la Universidad de Colima el Lic. Jorge Humberto Silva Ochoa, antes de que se constituyeran los Centros Universitarios de Investigación.
En un principio, la dirección del Instituto Universitario de Investigaciones Jurídicas estuvo a cargo del Lic. Guillermo Ruelas Ocampo, período en el cual se publicó la colección “Leyes y Decretos de Colima, 1857-1910.” Posteriormente, el Lic. Héctor Gustavo Anguiano Sánchez ocupó el cargo de director del Instituto, quien en coordinación con la Facultad de Derecho dirigió la edición de los Códigos de Procedimientos Penales y Civiles del estado de Colima, así como el Código Civil y el Penal, ambos del estado de Colima.
Durante los años comprendidos de 1995 a 1998, el Lic. Felipe Chávez Carrillo fungió como encargado del Instituto y, posteriormente, pasó a ocupar el cargo de magistrado del Supremo Tribunal de Justicia del estado. El 27 de febrero de 1998, el rector Dr. Carlos Salazar Silva, designó al Lic. Carlos de la Madrid Virgen como director del Instituto Universitario de Investigaciones Jurídicas, cargo que ocupó hasta mayo de 2009.
Durante el período comprendido de mayo del 2009 a agosto del 2014, el Dr. Óscar Javier Solorio Pérez fungió como director de este Instituto, tiempo en el cual se consolidó como un espacio de investigación y formación continua, con sentido innovador y competitivo para la comunidad jurídica. El Dr. Carlos Garibay Paniagua asumió la dirección de este Instituto a partir del mes de agosto del 2014 a 2022.
A partir del 1 de mayo del 2022, se designa un nuevo director el Dr. Luis Enrique Cárdenas Voges, el cual continúa hasta la fecha.