Al titular de la Contraloria General, de manera genérica, le corresponderá el ejercicio de las siguientes facultades y obligaciones:
- Presentar al Rector, su Plan Operativo Anual, Programa de Auditorías y de Visitas de Inspección en sus diferentes modalidades y su Informe de actividades, conforme a la normativa universitaria.
- Fungir como autoridad substanciadora y resolutora, en los términos establecidos en la Ley General.
- Formular con base en el resultado de las auditorías, un informe al Rector y, en su caso, efectuar las observaciones y recomendaciones necesarias a los planteles y dependencias universitarias.
- Desempeñar los encargos que el Rector le encomiende y por acuerdo expreso, representar a la Universidad de Colima en las comisiones, consejo u órganos en las que participe la institución.
- Coadyuvar al funcionamiento del sistema de control interno de la institución, así como proponer mejoras al mismo.
- Vigilar la atención a las recomendaciones derivadas de las Auditorías y Visitas de Inspección realizadas.
- Firmar los documentos relativos al ejercicio de las facultades que le hayan sido autorizadas.
- Proponer al Rector, la elaboración y/o actualización de la normativa aplicable en el ámbito de sus funciones y atribuciones.
- Las demás que le confiere la normativa aplicable vigente y las que le asigne el Rector.