La historia de la educación media superior en la Universidad de Colima, arranca en agosto de 1955 con la creación del Bachillerato único por el Decreto 50 del H. Congreso del Estado, con planes y programas aprobados por la conferencia regional de la ANUIES, iniciando labores en las instalaciones de la Esc. Primaria “Gregorio Torres Quintero” de esta ciudad. Fungía como Rector en ese entonces el Profr. Ricardo Guzmán Nava y el primer director fue el Lic. Arturo Noriega Pizano.
En 1985, mediante el Acuerdo No. 40 del H. Consejo Universitario, se crea la Dirección de Educación Media Superior y Terminal, para coordinar los trabajos de los diferentes bachilleratos con que ya se contaba.
En el año 2000, mediante el Acuerdo No. 24, se modifica la denominación de la Dirección, quedando desde entonces como Dirección General de Educación Media Superior (DGEMS).
Actualmente, la DGEMS coordina los trabajos de 35 bachilleratos, la Escuela Técnica de Enfermería, el bachillerato del Instituto Universitario de Bellas Artes (IUBA) y 9 (nueve) escuelas incorporadas con una matrícula aproximada de 15 mil estudiantes, atendida por aproximadamente 800 docentes.