La Coordinación General Administrativa y Financiera fue creada mediante el Acuerdo No. 10 de 1985; actualmente rige su quehacer con base en el Acuerdo No. 20 de 2018, donde se encuentran enunciadas sus funciones y responsabilidades, con la finalidad de contribuir al cumplimiento de los objetivos planteados en el Plan Institucional de Desarrollo documento rector del trabajo universitario. A partir del mes de marzo del 2018, están bajo la jurisdicción de la Coordinación General Administrativa y Financiera las siguientes dependencias:
Tesorería, Dirección General de Recursos Humanos, Dirección General de Administración Escolar, Dirección General de Recursos Materiales, Dirección General de Servicios Universitarios, Dirección de Proyectos Específicos, Dirección de Contaduría, Dirección de Proveeduría y Servicios, Dirección de Control Presupuestal y la Dirección de Patrimonio Universitario.