Las instalaciones de Secretaría General de la Universidad de Colima se encuentran ubicadas en Campus Central, en el tercer piso del edificio de Rectoría.
Además de estos espacios, se encuentra la oficina de Protección Civil Universitaria, ubicada en el primer piso del Edificio Administrativo, donde se ubica la Dirección General de Administración Escolar.
Esta oficina se encuentra físicamente dentro de las instalaciones del Departamento de Desarrollo Humano del Centro Universitario de Bienestar Integral.