La FACIMAR cuenta con:
- 1 centro de cómputo que atiende los tres programas de estudio.
- 1 auditorio para 100 personas, equipado con sonido y videoproyector.
- 5 laboratorios (Laboratorio central, Laboratorio de Acuacultura, Laboratorio de Manejo Integral Costeros, Laboratorio de Oceanología Regional, Laboratorio de concreto).
- 3 edificios de aulas equipadas con videoproyector y pintarrón.
- 21 espacios individuales para trabajar en investigación, asesorías y tutorías a estudiantes.
- 1 Biblioteca de Ciencias del Mar, cuenta con 3,582 títulos de libros y 6,470 volúmenes para las carreras de FACIMAR. Cuenta también con cubículos de estudio y una sala audiovisual, computadoras con acceso a internet para consulta externa a la red de bibliotecas y consultas en internet.
- 1 oficina asignada a la actividad administrativa.
- 2 espacios para 15 personas, destinados para trabajo colegiado entre el cuerpo docente.
